Aquesta mesquita ha sigut, durant generacions, el lloc de les
protestes anti-Índia, i és un lloc on la gent es reuneix per parlar de la
situació política i el conflicte del Caixmir.
Durant el període Sikh (1819–1846), la mesquita va estar
tancada 21 anys; era durant el govern del maharajà Ranjit Singh, quan el
governador de Srinagar era MotiRam. L’any 1819 el governador va prohibir fer la
crida a l’oració i també anar-hi a resar. No es va reobrir la mesquita fins a
l’any 1843, quan el governador era Ghulam Muhi-ud-Din. Durant 11 anys, només es
va permetre l’oració dels divendres; la mesquita s’obria les hores justes per a
aquesta pregària i després es tornava a tancar.
Al maig del 2008, el govern de l’Índia i el govern estatal de
Jammu i Caixmir van arribar a un acord per transferir 99 acres de terra
forestal a la Junta del Santuari de Shri Amarnathji a la vall principal del Caixmir, per establir
refugis temporals i instal·lacions per als pelegrins hindús que anaven al
temple d’Amarnath.
A Srinagar, durant una de les manifestacions contra la
transferència de terres forestals, la policia va disparar contra la multitud i
van morir sis persones i 100 més van resultar ferides.
A rel d’això es van organitzar protestes, els líders de les
quals van acabar en arrest domiciliari. A tota l’àrea de Srinagar, la majoria
dels edificis públics, incloses escoles i oficines governamentals, i molts
negocis, van tancar.
Durant el govern de coalició liderat per Mehbooba Mufti, la
mesquita va tornar a estar tancada durant tres mesos, durant els disturbis del
2016, i de nou el 2017 i el 2018 durant diferents períodes de temps.
El 28 de desembre de 2018, un grup de joves emmascarats va
irrompre a la mesquita amb banderes de l’Estat Islàmic, després de les oracions
del divendres, quan la mesquita estava gairebé buida; el vídeo de l’incident es
va fer viral a les xarxes socials i va provocar la condemna d’una àmplia gamma
d’organitzacions i figures públiques. La setmana següent es va fer una
cerimònia per purificar la mesquita, i un altre dia se’n va fer una altra per
reiterar la seva importància i santedat.
L’arquitectura de la Jamia Masjid té influència persa amb
similituds amb les pagodes budistes. La mesquita ha patit molts danys al llarg
de la seva història, degut a incendis; va patir al menys tres incendis
devastadors i va ser restaurada després de cada desastre.